Peamised erinevused: koagulatsioon tähendab kohvimist; see viitab põhimõtteliselt keemilisele protsessile, milles toimub mittelahustuvate osakeste destabiliseerimine. Need osakesed moodustavad koagulandi abil tükke. Teisest küljest tähendab flokuleerimine flokkide moodustamist. Seda võib kirjeldada kui füüsikalist või mehaanilist protsessi, milles koaguleeritud tükid või flokid ühendatakse kokku, et moodustada massid ja seejärel sade.

Vesi võib sisaldada kolloidseid tahkeid aineid nagu mittelahenevad orgaanilised ained, saviosakesed, bakterid, plankton, lagunenud taimse materjali väikesed osakesed jne. Seega kasutatakse nende lisandite veest eraldamiseks koagulatsiooni ja flokulatsiooni meetodeid.
Koagulatsioon saavutatakse osakeste neutraliseerimise teel ja seega väheneb oluliselt osakeste vaheline tõrjuv jõud. Pärast flokulatsiooniprotsessi kasutamist moodustavad koaguleeritud osakesed suure aglomeratsiooni, mis on tuntud ka kui flok.

Flokuleerimisel on need destabiliseeritud osakeste aglomeraadid suurte osakeste kujul. Seda on võimalik saavutada ka suure molekulmassiga vees lahustuvate orgaaniliste polümeeride lisamisega. Nende polümeeride tõttu suureneb floki suurus ja seejärel settivad osakesi. On väga oluline, et flokuleeriv aine segataks aeglaselt aeglaselt nii, et väikesed flokid saaksid kergesti aglomeerida suurteks osakesteks ja lõpuks settida.
Vee töötlemiseks järgneb koagulatsioonile tavaliselt flokulatsioon.
Seega on mõlemad veepuhastuse osas kergesti eristatavad. Koagulatsiooni ajal lisatakse osakeste kokkukleepumiseks koagulant. Teisest küljest, flokuleerimise ajal segatakse lahus õrnalt, nii et koagulatsiooni käigus tekkivad väikesed tükid kogunevad kokku ja moodustavad suuremaid tükke. Need suured tükid settivad kergesti ja on seega eraldatavad.