Oluline erinevus : nii kofaktoril kui ka koensüümidel on organismi metaboolsetes funktsioonides äärmiselt oluline roll. Koensüüm on tehniliselt kofaktoritüüp, kus koensüümid on defineeritud kui molekulid, mis on lõdvalt seotud ensüümiga ja kofaktorid on need keemilised ühendid, mis seonduvad valkudega.

Organismi võime viia oma rakkudes läbi sadu keemilisi reaktsioone on see, mis eraldab organismi elumatu objektist. Need reaktsioonid on elulemuse seisukohalt äärmiselt olulised ja neid teostavad organismis esinevad ensüümid, koensüümid, rakud ja üksused. Nendest on ensüümid olulised valgud, mis aitavad reguleerida organismi metaboolseid ja keemilisi reaktsioone.

Muud ühendid, mis mõjutavad neid reaktsioone, on koensüümid ja kofaktorid, mis on ensüümide reaktsioonide elluviimiseks elulise tähtsusega. Kuigi mõlemal on reaktsioonis erinevad funktsioonid ja omadused, on koensüüm kofaktori derivaat. See võib olla väga segane, mistõttu on oluline mõista kahe keemilise ühendi vahelisi erinevusi.

Kofaktor on mittevalgulised keemilised ühendid, mis on tihedalt või lõdvalt seotud ensüümiga (valk), et suurendada ühendi bioloogilist aktiivsust. See on äärmiselt oluline ja seda kasutatakse reaktsiooni katalüsaatorina. Seda nimetatakse ka "abistaja molekuliks" selle biokeemiliste muutuste tõttu reaktsioonides. On kofaktorite tüüpe:

• Coenzymes
• Proteetilised rühmad

Teisest küljest on koensüümid defineeritud kui väikesed, orgaanilised, mitte-valgu molekulid, nagu vitamiinid, mis kannavad ensüümide vahel keemilisi rühmi. Kuigi seda ei peeta ensüümi struktuuri osaks, toimivad ensüümid reaktsiooni jaoks koensüümid. Seda tuntakse ka kaas-substraatidena.

Kuigi koensüüm on teatud tüüpi kofaktor, on see keemiline molekul ja kofaktor on keemiline ühend. Samuti on koensüüm ensüümi lõdvalt seotud kofaktor, samas kui kofaktor on tihedalt seotud valkudega reaktsioonis. Reaktsiooni ajal toimivad koensüümid vahe-kandjatena, kusjuures nad tagavad, et spetsiifilised aatomid viiakse läbi konkreetsesse rühma, nii et üldine reaktsioon viiakse läbi ja viiakse lõpule kergesti.

Kofaktorid on seevastu vajalikud ja vajalikud reaktsiooni kiiruse suurendamiseks ja analüüsimiseks, st kui kiiresti katalüsaator toimib reaktsiooni lõpuleviimiseks. Paljudel juhtudel on kofaktoritel ja koensüümidel sarnased funktsioonid nagu nende keemiliste reaktsioonide reguleerimine, kontrollimine ja kiiruse reguleerimine ning nende mõju kehale. Nende kahe vahelised erinevused on toodud alljärgnevas tabelis.

Cofactori ja koensüümi võrdlus:

	Kofaktor	Koensüüm
Määratlus	See on mittevalgulised keemilised ühendid, mis on tihedalt või lõdvalt seotud ensüümiga (valk).	See on määratletud kui väikesed orgaanilised mittevalgulised molekulid, mis kannavad ensüümide vahel keemilisi rühmi.
Omadused	Need on anorgaanilised ained.	Need on orgaanilised ained.
Funktsioon	See aitab kaasa bioloogilistele muutustele.	See aitab või aitab ensüümi toimimist.
Tüüp	Need on keemilised ühendid.	Nad on keemilised molekulid.
Seotud	See on tihedalt seotud ensüümiga.	See on lõdvalt seotud ensüümiga.
Meede	Reaktsiooni kiiruse suurendamiseks toimivad nad katalüsaatoriga.	Nad toimivad ensüümidena.
Näide	Metallist ioonid nagu Zn ++, K + ja Mg ++ jne.	Vitamiinid, biotiin, koensüüm A jne