Oluline erinevus: JRE tähistab Java Runtime Environment. Java byteekoodi käivitamiseks kasutatakse Oracle'i Java-rakenduskeskkonda. Teisest küljest on SDK või tarkvaraarenduskomplekt tarkvaraarendusvahendite komplekt. Neid kasutatakse peamiselt erinevate rakenduste loomiseks. JRE-d kasutatakse nende ja teiste Java-programmide käivitamiseks.
SDK-d sisaldavad sageli faile, mis liidetakse konkreetse programmeerimiskeelega, keeruka riistvaraga, et suhelda teatud varjatud süsteemiga, abivahendite ja muude abivahendite silumisvahendeid, samuti näidiskoodi, toetavaid tehnilisi märkusi või muid täiendavaid dokumente, et selgitada esmase viite punkte materjali. Samamoodi on JDK kaasas JRE ja mitmesugused arendusvahendid nagu Java raamatukogud, Java allika kompilaatorid, Java debuggers, sidumis- ja kasutuselevõtu tööriistad.
JRE ja SDK vahe võib kokku võtta. SDK-d või pigem saab JDK-d kasutada programmide kompileerimiseks Java-bytecode'i. Java bytecode on standardne kaasaskantav binaarne formaat, mis tavaliselt kuulub .class-failidena. Programmid võivad olla paljude klasside ja erinevate failidega.
Programmi käivitamiseks tuleb baidikood seejärel teisendada vastavateks käskudeks, mida kohalik operatsioonisüsteem mõistab. Selleks kasutatakse JRE-d. JRE-l on erinevaid versioone, mis tõlkivad vastava operatsioonisüsteemi baitkoodi, st ühe Windows XP jaoks, ühe Windows Vista jaoks, ühe Windows 7 jaoks, ühe Windows 7 jaoks, ühe Mac Snow Leopardile jne. JRE kogu funktsioon on arvuti lubamine. Java-programmi käivitamiseks.
Sisuliselt kasutatakse JDK-d enda Java-programmide kirjutamiseks või kompileerimiseks, samas kui JRE-d kasutatakse nende ja teiste Java-programmide käivitamiseks, mis on Internetis kergesti kättesaadavad. Mitmed rakendused ja mängud põhinevad praegu Java'il.