Peamine erinevus: Nende kahe raku peamine erinevus on see, et prokarüootsetel rakkudel ei ole põhimõtteliselt tuuma, samas kui eukarüootsetel rakkudel on tõelised tuumad. Eukarüootsed rakud on suuremad ja keerukamad kui prokarüootsed rakud.

Kõiki elusorganisme saab sorteerida ühte kahest rühmast sõltuvalt nende rakkude põhistruktuurist. Rakkude kaks peamist klassi on prokarüootid ja eukarüootid. Neil kahel rakutüübil on palju ühist. Nad täidavad samu funktsioone ja samamoodi. Mõlemad on ümbritsetud plasmamembraanidega, mis on täidetud tsütoplasma ja mis on koormatud väikeste struktuuridega, mida nimetatakse ribosoomiks. Mõlemal on DNA, mis kannab arhiveeritud juhiseid raku käitamiseks. Siiski on kahe rakutüübi vahel vähe erinevusi.

Termin prokarüoot on tuletatud kreeka sõnast „prokarüoot”, mis tähendab enne tuuma. Prokarüootid on organismid, mis koosnevad rakkudest, millel puudub raku tuum või mistahes membraaniga kaetud organellid. See tähendab, et neil ei ole tuuma. Samuti ei ole prokarüootides olev geneetiline materjal, st DNA, seotud tuumaga. Lisaks on DNA vähem struktureeritud ja on ühes silmus. Enamik prokarüootidest koosnevad vaid ühest rakust ja neid nimetatakse ühekordseks organismiks. On olemas ka mõned prokarüootid, mis on valmistatud rakkude kogumist ja mida nimetatakse mitmik-rakulisteks organismideks. Prokarüootid on jagatud kahte rühma:

• Bakterid
• Archaea

Eukarüootid on organismid, mis koosnevad rakkudest, millel on nii membraaniga seotud tuum kui ka membraaniga seotud organellid. Termin eukarüoot pärineb kreeka sõnast „œeukaryoteâ”, mis tähendab tõelist või head tuuma. See rakk sisaldab kõiki eluvaldkondi peale monera. Need organismid hoiavad oma rakkudes geneetilist materjali. Eukarüootide geneetiline materjal sisaldub rakus olevas tuumas. Nende organismide DNA on struktureeritud ja organiseeritud kromosoomideks. Samuti on DNA lineaarne ja seostub valkudega kromatiini moodustamiseks. Eukarüootsed organismid võivad olla multi-rakulised või ühe rakuga organismid. Kõiki loomi peetakse eukarüootideks. Teiste eukarüootide hulka kuuluvad taimed, seened ja protistid.

Prokarüootsed ja eukarüootsed rakud on mõlemad omavahel seotud suuruse ja keerukusega. Need rakud erinevad üksteisest. Siiski on need selgelt sarnased kui erinevad ja need on selgelt omavahel seotud. Bioloogid usuvad, et eukarüootne rakk on selgelt arenenud prokarüootsest rakust.

Prokarüootsete ja eukarüootsete rakkude võrdlus:

	Prokarüootne rakk	Eukarüootne rakk
Määratlus	Need on organismid, mis koosnevad rakkudest, millel puudub raku tuum või mistahes membraaniga kaetud organellid.	Need organismid koosnevad rakkudest, millel on membraaniga seotud tuum ja membraaniga seotud organellid.
Nucleus	Tal pole tuuma.	Sellel on tõeline tuum, mida piirab topeltmembraan.
DNA korraldus	See on ringikujuline.	See on lineaarne.
Suurus	Väikesed rakud (<5 µm)	Suured rakud (<10 µm)
Cell	Alati ühekordne	Enamasti multi-rakulised
Raku sein	Tavaliselt esineb; keemiliselt keeruline	Kui see on olemas, on see keemiliselt lihtne
Valk	See ei sisalda DNA-s valku.	See sisaldab DNA-s olevaid valke kromatiini moodustamiseks.
Ribosoom	See sisaldab väikeseid ribosoome.	See sisaldab suuri ribosoome.
Tsütoplasma	Ei tsütoskeleti	Alati peab olema tsütoskelett
Raku pooldumine	Rakkude jagunemine toimub binaarse lõhustumise teel	Rakkude jagunemine toimub mitoosi kaudu
Paljundamine	Paljundamine on alati ebatavaline	Paljundamine on ebatavaline või seksuaalne
Ainevahetusradad	Suur metaboolsete radade valik	Üldised metaboolsed teed
Flagella	Koosneb kahest valgu ehitusplokist	See on oma olemuselt keeruline ja koosneb mitmest mikrotuubulist
Mitme rakuga vormid	Haruldane	Sage koos ulatusliku kudede moodustumisega
Mesosoomid	Nad täidavad golgi-organite ja mitokondrite funktsioone ning aitavad ka kromosoome eraldada.	Ei ole kohal
Plasma membraan	Ei süsivesikuid ega ole steroole	Steroolid ja süsivesikud on mõlemad
Glycocalyx	Esineb kapsli või lima kihina	Esineb mõnes rakus, mis ei oma rakuseina
Näide	Bakterid ja arhiiv	Loomarakud ja taimerakud