Peamised erinevused: Taime vars vastutab puu lehtede, lillede või viljade toetamise eest. Teisest küljest annab puu tüvi kogu puule struktuuri, sealhulgas varred, lehed, lilled ja puuviljad. Trunk ühendab ka lehed juurtega.
Varred ja kohvrid on tavalised sõnad, mida kuulatakse botaanikas. Nad on osa taimedest ja erinevad üksteisest, kuigi nende tõttu võivad nad mõlemad olla osa taimedest segaduses. Pagas on selle puu põhistruktuur, mis toetab kogu puu. Sõna vars viitab tavaliselt taimedele, samas kui pagasiruumi all mõeldakse puu.

Taime vars on üks vaskulaarse taime kahest peamisest struktuuriteljest. Varre võib jagada kaheks osaks; sõlme ja internode. Interoodid vastutavad pungade või uute lehtede hoidmise eest, samas kui internood on kahe sõlme vaheline kaugus. Varred paiknevad selle tüve konstruktsioonil, mis on tuntud kui vars ja millel on neli põhifunktsiooni.
Varred on vastutavad lehtede, lillede, puuviljade ja muude varrede toetamise eest, vedeliku vedu juurte ja ülejäänud taime vahel, toitainete säilitamine ja uue elava koe tootmine. Tehasel on mitu tüve ja varre elutsükkel on üks kuni kolm aastat. Mõned taimede varred tarbitakse toiduna.

Trunk või bool viitab puu põhistruktuurile, mis vastutab kogu puu toetamise eest. Pagas vastutab harude toetamise ja puu juurte ühendamise eest, võimaldades tal pääseda ellujäämiseks vajalikele toitainetele. Pagas on kaetud koorega, mis on varrega võrreldes tekstuuri poolest erinev. See on ka kaetud rõngastega, mis aitavad määrata puude vanust. Puude pagasiruumis ei pruugi sellest välja jääda lehti. Pagasiruumil ja koorel on oluline kasutus tööstuslikes rakendustes, nagu saematerjal, paber, mööbel, ehitus, ehitus jne.