Peamine erinevus: pürimidiin on heterotsükliline aromaatne orgaaniline ühend, mis koosneb lämmastikust ja süsinikust. Puriin on ka heterotsükliline aromaatne orgaaniline ühend, mis koosneb pürimidiinitsüklist, mis on sulandatud imidasoolitsükliga. Primimidiinalused koosnevad ühest tsükli struktuurist, samas kui puriinid koosnevad sulatatud topeltrõngast. Need erinevad paljudes aspektides, nagu sulamistemperatuur, keemispunkt jne.

Pürimidiin on heterotsükliline või kuueliikmeline lämmastiku heterotsükliline ühend, millel on molekulaarne valem C4H4N2. Heterotsüklilised ühendid viitavad orgaanilistele ühenditele, millel on tsükli struktuur, mis sisaldab aatomeid nagu väävel, hapnik või lämmastik. Pürimidiinid on looduses saadaval erinevates vormides.

Sõna „pürimidiin” on Pinneri poolt välja töötanud 1884. aastal, kes ühendas sõnad püridiin ja amidiin, moodustades pürimidiini; nende ühendite struktuurilise sarnasuse alusel. See sisaldab kahte lämmastiku aatomit suguelundi ringi esimesel ja kolmandal positsioonil.

Puriin viitab heterotsükliliste ühendite rühmale, mis koosneb kahest tsükli struktuurist, mis koosneb süsiniku- ja lämmastikuaatomitest. Puriin on heterotsükliline orgaaniline ühend, mis koosneb pürimidiinitsüklist, mis on sulandatud imidasoolitsükliga. Mõiste puriin on välja töötatud Emil Fischeri poolt 1884. aastal. Sarnaselt pürimidiiniga moodustab see ka lämmastiku aluste rühma. Need on nukleiinhapete komponendid.

Pürimidiinid ja puriinid on kaks erinevat orgaaniliste aluste rühma. Pürimidiinid kalduvad olema puriinidega võrreldes väiksemad, kuna pürimidiinid sisaldavad ühte rõngastatud struktuuri ja Puriinidel on topeltrõngstruktuur.

Pürimidiini ja puriini alused on elu jaoks väga olulised, kuna need sisalduvad DNA ja RNA struktuuris. Mõlemad kuuluvad orgaaniliste ühendite ja aromaatsete heteropolytsükliliste ühendite kuningriiki. Pürimidiinid kuuluvad Diaziinide klassi, samas kui Puriinid kuuluvad klassi Imadazopyrimidines. Puriinide molekulid on keerulised ja raskemad kui pürimidiinide molekulid ning seetõttu on neil kõrge sulamis- ja keemispunkt kui pürimidiinidel.

Puriini ja pürimidiini võrdlus:

	Pürimidiinid	Puriinid
Mõisted	Pürimidiin on lämmastikust ja süsinikust koosnev heterotsükliline aromaatne orgaaniline ühend.	Puriin viitab heterotsükliliste ühendite rühmale, mis koosneb kahest tsükli struktuurist, mis koosneb süsiniku- ja lämmastikuaatomitest
Näide Nukleotiidid	Tümiin, uratsiil ja tsütosiin	Adeniin ja guaniin
Struktuur	Sisaldab 1 süsinik-lämmastiku ringi ja 2 lämmastikuaatomit	Koosneb pürimidiinitsüklist, mis on sulandatud imidasoolitsükliga. Sisaldab kahte süsiniku lämmastiku rõngast ja nelja lämmastikuaatomit.
Molekulaarne valem	C4H4N2	C5H4N4
Sulamistemperatuur ja keemispunkt	Võrreldes madalamad sulamis- ja keemispunktid	Suhteliselt kõrged sulamis- ja keemispunktid
Funktsioon lähtemolekulidena	Ei ole teada, et see toimiks lähtemolekulidena	Funktsioon on lähtemolekulid keemiliste ühendite sünteesil, nagu näiteks fülliin